中心有随时可调用的"中国海监"海洋调查船、海洋遥测浮标和装备了侧视雷达、微波辐射仪、高光谱成像仪等先进设备的"中国海监"飞机等多种海洋监测调查平台，具有对海上突发事件的快速反应能力以及全天候、连续的海洋监测、调查能力。
中心配备先进的仪器设备可以进行：油类、气相色谱、重金属、常规化学、浮游生物、毒性生理、底栖生物、微生物、贝类毒性、地球化学等分析工作，从事液体、气体、固体等介质13类（水质、沉积物和土壤、测绘与地球物理探测、生物、大气、降水、水文、气象、食品、化妆品、消油剂、海洋石油勘探开发污染物、油类）共155个项目的化验、检测工作。
 美国海岛公司Seabird 911 Plus 温盐深仪 |
 ADCP美国RD Instrument深层升学多普勒剖面仪 |
 纯水及超纯水设备 |
 总有机碳分析仪 |
 微波消解装置 |
 旋转蒸发仪 |
 气相色谱-质谱联用仪 |
 叶绿素a荧光计 |